Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SvoplQ6PDF3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SvoplQ6PDF3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms