Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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