Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpa4Q6P8K8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpa4Q6P8K8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms