Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms