Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc2Q69ZB8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms