Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms