Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab3ipQ68EF0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab3ipQ68EF0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab3ipQ68EF0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms