Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms