Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Taf6Q62311 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Taf6Q62311 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Taf6Q62311 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms