Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms