Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pabpc2Q62029 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms