Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga6Q61739 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms