Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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AtrxQ61687 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms