Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim25Q61510 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms