Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms