Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Acvr1bQ61271 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acvr1bQ61271 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms