Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamb3Q61087 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms