Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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