Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurod1Q60867 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurod1Q60867 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms