Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samhd1Q60710 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms