Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms