Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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