Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr7Q3V0I2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr7Q3V0I2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms