Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm12888Q3UW77 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms