Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms