Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms