Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek10Q3UGM2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek10Q3UGM2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms