Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms