Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms