Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms