Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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