Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uri1Q3TLD5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uri1Q3TLD5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms