Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col24a1Q30D77 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col24a1Q30D77 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms