Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd11Q1RNF8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms