Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf541Q0GGX2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms