Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc7a1Q09143 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc7a1Q09143 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms