Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn3Q07409 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms