Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms