Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh3bp2Q06649 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms