Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cab39Q06138 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms