Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms