Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GscQ02591 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GscQ02591 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms