Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb2Q00977 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb2Q00977 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms