Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lig3P97386 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms