Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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