Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx3P81067 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms