Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Otx2P80206 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms