Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx1P80205 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Otx1P80205 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms