Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf3P70671 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms