Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rad54lP70270 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rad54lP70270 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rad54lP70270 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rad54lP70270 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rad54lP70270 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad54lP70270 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms